در این داستان، شخصیت‌های مختلف با انگیزه‌های متفاوت درگیر ماجراجویی‌ها و اتفاقات غیرقابل پیش‌بینی می‌شوند. برخی به دنبال قدرت جاودانگی هستند، برخی در پی انتقام و برخی دیگر فقط می‌خواهند زنده بمانند. در این میان، شیمی‌دانان با تلاش برای ایجاد اکسیر جاودانگی، تعادل و آرامش را در این دنیای آشفته به خطر می‌اندازند.

داستان این انیمه که بر اساس انیمه سریالی "گینتاما" ساخته شده و به عنوان پایان داستان سریال به حساب می آید، از این قرار است که "گینتوکی"، "تاکاسوگی" و "کاتسورا" با نیروهایی که مقر ترمینال را تصرف کرده اند، می جنگند. مادر در بالای مقر، مقادیر زیادی آلتانا را جذب می کند و آن را به کودک شویو می دهد تا او را زنده و جاودانه کند. اما در همین حال حملات شدیدی صورت می گیرد و ....

ماشینی که به روان‌شناسان اجازه می‌دهد به رویاهای بیمارشان وارد شوند، دزدیده می‌شود، اوضاع بهم می‌ریزد و به خشونت کشیده می‌شود. تنها یک روانشناس جوان به‌نام «پاپریکا» می‌تواند این جریان را متوقف کند و...